Train Heartnet, poznati kao Black Cat, je 13. Kronos Number, opasan ubojica jedne organizacije koja radi skriveno da bi ga kontrolirala svijet. Sven je jedan Sweeper, stalno gladan a uvijek bez novca, koji prihvaća da uhvati jednog političara jer ima posla s "mafijom". Ali i Train ima zadatak oko istog političara, samo što ga on mora ubiti. Tako ceste tih dviju likova će se spojiti.
Pomalo Train se zaljubljuje u jednu Sweepericu, ali jedan od Kronos Number shvaća da ga ona udaljuje od njihove organizacije i zato je ubije. Train nakon tog bolnog događaja, napušta Kronos i novi cilj mu je ubiti Creeda (ubojicu voljene cure, koji je nakon Traina i on napustio Kronos i stvorio svoju organzaciju u koju želio bi uklopiti i Traina).
Onda u ovom Anime ima i jedna djevojčica (ili biološko oružje), Eve. Napravljena je nanotehnološki i spremaju je za uništenje svijeta. Al prije nego što je kompletirana, Sven se upozna s njom i sprijatelji, uvjerava je da je ona čovjek kao i svi drugi i otkriva joj dobre stvari (za jesti) svijeta.